Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr1270-205ENSMUST00000216354 4836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Mir680-1-201ENSMUST00000102257 109 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm16125-201ENSMUST00000159003 339 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm34768-201ENSMUST00000193884 565 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 1300002E11Rik-206ENSMUST00000209728 701 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FxnO35943 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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FxnO35943 Gm24968-201ENSMUST00000179817 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FxnO35943 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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