Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rian-214ENSMUST00000183026 596 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1013-201ENSMUST00000065626 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12515-201ENSMUST00000120116 361 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC166369.3-201ENSMUST00000227286 409 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr825-201ENSMUST00000076814 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps24-202ENSMUST00000169826 519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esp38-201ENSMUST00000178880 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv6-5-201ENSMUST00000179796 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18903-201ENSMUST00000215343 480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122465.3-201ENSMUST00000221644 355 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Tpm3-rs7D3Z2H9 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms