Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm29730-201ENSMUST00000192986 1396 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 AC151730.2-201ENSMUST00000224027 475 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm10665-201ENSMUST00000098720 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm10666-201ENSMUST00000098722 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm15060-201ENSMUST00000119550 948 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Ang-ps3-201ENSMUST00000177964 433 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r68-201ENSMUST00000058362 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Olfr134-201ENSMUST00000074883 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Phf11bB4XVQ1 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gemin6-ps-201ENSMUST00000120444 501 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm23326-201ENSMUST00000157419 105 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm26988-201ENSMUST00000183296 945 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Mir6914-201ENSMUST00000184999 69 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Phf11bB4XVQ1 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms