Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm17820-201ENSMUST00000220213 1068 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23365-201ENSMUST00000175019 125 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm25960-201ENSMUST00000175110 125 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm44453-201ENSMUST00000175161 126 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm25195-201ENSMUST00000177656 126 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28339-201ENSMUST00000185845 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28596-201ENSMUST00000185870 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29062-201ENSMUST00000186032 694 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28057-201ENSMUST00000186603 615 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28896-201ENSMUST00000188609 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm32295-201ENSMUST00000192558 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm31260-201ENSMUST00000193478 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm38107-201ENSMUST00000194873 696 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm43236-201ENSMUST00000197414 313 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Stk31-202ENSMUST00000163954 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.3 ms