Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1454-204ENSMUST00000217568 4215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Prl2c1-201ENSMUST00000054932 681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr679-201ENSMUST00000098158 952 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm27192-201ENSMUST00000136428 581 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm20777-201ENSMUST00000177818 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm20737-201ENSMUST00000179665 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm21310-201ENSMUST00000180130 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm45105-201ENSMUST00000207824 397 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm45029-201ENSMUST00000208702 391 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CtcflA2APF3 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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