Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm22392-201ENSMUST00000177971 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm7530-201ENSMUST00000218466 605 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 AC151843.1-201ENSMUST00000215960 691 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm6841-201ENSMUST00000220602 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cln8Q9QUK3 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm23205-201ENSMUST00000158671 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cln8Q9QUK3 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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