Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr441-202ENSMUST00000213649 2402 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm16490-201ENSMUST00000165299 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37834-201ENSMUST00000194517 3035 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-216ENSMUST00000189533 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Rabgef1Q9JM13 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Angpt1-201ENSMUST00000022921 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Mir6413-201ENSMUST00000184049 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC151971.3-201ENSMUST00000214694 404 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm18442-201ENSMUST00000220925 639 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm20667-201ENSMUST00000175674 1930 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Zfp120-203ENSMUST00000109931 4033 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Rabgef1Q9JM13 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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