Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 9530003O04Rik-201ENSMUST00000192663 908 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm44849-201ENSMUST00000207595 484 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm16212-202ENSMUST00000143555 420 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Prl7c1-201ENSMUST00000072943 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r185-212ENSMUST00000228633 5385 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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Zbed3Q9D0L1 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm43923-201ENSMUST00000203992 2911 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Zbed3Q9D0L1 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms