Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm13743-201ENSMUST00000121486 724 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 AC153361.2-202ENSMUST00000220405 842 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr1158-201ENSMUST00000102622 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Fbxw23-201ENSMUST00000198015 425 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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