Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr916-201ENSMUST00000081196 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Nlrp4d-201ENSMUST00000182420 2946 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Sde2Q8K1J5 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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