Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 AC161520.1-201ENSMUST00000210954 939 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Olfr1205-202ENSMUST00000215929 6149 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Vmn2r-ps57-201ENSMUST00000173861 2598 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm19203-201ENSMUST00000174049 939 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
NischQ80TM9 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm11665-201ENSMUST00000148136 285 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm9587-201ENSMUST00000172449 454 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 4933402J10Rik-202ENSMUST00000198882 1167 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm43478-201ENSMUST00000200381 292 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Themis-201ENSMUST00000056097 5082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Tshb-206ENSMUST00000200041 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm4057-201ENSMUST00000221407 368 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm9078-201ENSMUST00000119126 617 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm20574-201ENSMUST00000182867 917 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Mrgprb12-ps-201ENSMUST00000186150 949 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm38997-201ENSMUST00000205669 304 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
NischQ80TM9 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.5 ms