Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 mt-Cytb-201ENSMUST00000082421 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr1012-202ENSMUST00000214255 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Syne2-210ENSMUST00000143031 21704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Cst12-202ENSMUST00000168443 546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm27718-201ENSMUST00000183721 86 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm8498-201ENSMUST00000188227 974 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC154305.1-201ENSMUST00000224443 450 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC153969.1-201ENSMUST00000214047 2605 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Vmn1r10-202ENSMUST00000228270 2084 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 AC142245.1-201ENSMUST00000226611 1505 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm15533-201ENSMUST00000126205 465 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Rbbp4Q60972 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms