Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm10256-201ENSMUST00000179404 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr148-202ENSMUST00000216801 2775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm7452-202ENSMUST00000202891 3039 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm22514-201ENSMUST00000122547 308 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm8206-202ENSMUST00000168733 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm28412-201ENSMUST00000187243 177 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm35212-201ENSMUST00000196672 606 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Trim71Q1PSW8 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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