Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

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Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprvP70289 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
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PtprvP70289 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprvP70289 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprvP70289 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
PtprvP70289 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprvP70289 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
PtprvP70289 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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