Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 9430099M06Rik-201ENSMUST00000210409 742 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm45379-201ENSMUST00000211772 549 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm13058-201ENSMUST00000117097 1435 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Sult1b1-201ENSMUST00000031199 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1027-ps1-201ENSMUST00000122338 875 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm14095-201ENSMUST00000134264 516 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm22600-201ENSMUST00000157598 269 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 4930554C24Rik-201ENSMUST00000187735 1084 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm43150-201ENSMUST00000200931 636 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm43295-201ENSMUST00000201439 412 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm35405-201ENSMUST00000218754 400 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr850-201ENSMUST00000077347 948 ntAPPRIS P2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm6215-201ENSMUST00000119297 1386 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r51-207ENSMUST00000227766 4218 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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