Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Zfp873-201ENSMUST00000105313 1893 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm27528-201ENSMUST00000183544 205 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm26330-201ENSMUST00000082817 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Nme7-202ENSMUST00000191947 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr147-202ENSMUST00000214648 5356 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Dst-215ENSMUST00000185269 16340 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Ube2l3-ps1-201ENSMUST00000199777 436 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC121599.1-201ENSMUST00000224276 449 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm37767-201ENSMUST00000193239 1834 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 A530083M17Rik-201ENSMUST00000199877 3376 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Spocd1B1ASB6 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms