Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm37866-201ENSMUST00000191950 696 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm35552-201ENSMUST00000214355 396 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm7099-201ENSMUST00000080066 554 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37211-201ENSMUST00000193392 3433 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Olfr706-202ENSMUST00000213918 4828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Grik3B1AS29 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms