Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Copg2-201ENSMUST00000048774 3961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm20789-201ENSMUST00000221002 4195 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Skil-204ENSMUST00000118470 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AC154682.1-201ENSMUST00000225871 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Npsr1-201ENSMUST00000059650 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm14175-201ENSMUST00000119835 241 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm22259-201ENSMUST00000178926 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm27747-201ENSMUST00000184707 85 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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Limd1Q9QXD8 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm5027-201ENSMUST00000206700 375 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Npy2r-202ENSMUST00000098997 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Cbx5-201ENSMUST00000108813 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Pramel3-202ENSMUST00000118821 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Ktn1-223ENSMUST00000190999 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Olfr1279-202ENSMUST00000213823 3299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm10310-202ENSMUST00000213667 4661 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
Limd1Q9QXD8 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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