Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm3189-201ENSMUST00000205595 832 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Cacnb4-202ENSMUST00000102760 7872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm12103-201ENSMUST00000121892 362 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm17109-201ENSMUST00000163985 358 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr1020-202ENSMUST00000215347 2640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Tas2r122-201ENSMUST00000105077 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm6501-201ENSMUST00000187178 916 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 1700044K03Rik-201ENSMUST00000190201 377 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm25135-201ENSMUST00000082648 143 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm9921-201ENSMUST00000173293 4399 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm45137-201ENSMUST00000208652 4415 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Usp29Q9ES63 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms