Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Ccdc47Q9D024 Gabra2-203ENSMUST00000197284 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm12427-201ENSMUST00000117719 302 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm5473-201ENSMUST00000179326 642 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm14589-201ENSMUST00000121640 727 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm11479-201ENSMUST00000134275 387 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm27538-201ENSMUST00000185065 294 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Vmn1r17-202ENSMUST00000227966 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr1408-201ENSMUST00000073663 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm22310-201ENSMUST00000157509 116 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm26915-201ENSMUST00000183080 748 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Ccdc47Q9D024 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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