Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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Hdac9Q99N13 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Hdac9Q99N13 Gm44800-201ENSMUST00000207510 1855 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm27733-201ENSMUST00000184803 68 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Lrp1b-201ENSMUST00000052550 16294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Hdac9Q99N13 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm11823-201ENSMUST00000130582 2278 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Gm10811-201ENSMUST00000221985 2448 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Hdac9Q99N13 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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