Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm9320-201ENSMUST00000184151 473 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm43441-201ENSMUST00000201458 205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Spata22-202ENSMUST00000092926 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Il6st-204ENSMUST00000183829 612 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr956-ps1-201ENSMUST00000216492 867 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm7957-201ENSMUST00000207404 2602 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Smim11aQ99J19 Gm12505-201ENSMUST00000146041 757 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms