Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Smg8Q8VE18 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg8Q8VE18 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg8Q8VE18 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg8Q8VE18 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
Smg8Q8VE18 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm11366-201ENSMUST00000119279 429 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm9317-201ENSMUST00000197055 862 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC125543.1-201ENSMUST00000222778 101 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm17308-201ENSMUST00000181749 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Lcor-202ENSMUST00000163929 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm24715-201ENSMUST00000102377 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm12281-201ENSMUST00000119536 298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm2497-201ENSMUST00000189539 601 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm6850-201ENSMUST00000210031 530 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Herc2-202ENSMUST00000164095 15261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Bclaf1-201ENSMUST00000043881 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Smg8Q8VE18 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms