Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm15854-201ENSMUST00000118879 808 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Rpl23a-ps5-201ENSMUST00000194566 466 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm19243-201ENSMUST00000198592 269 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm8745-201ENSMUST00000207846 782 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm9628-201ENSMUST00000222169 725 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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Usp38Q8BW70 Rpl23a-ps12-201ENSMUST00000179178 468 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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Usp38Q8BW70 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm24147-201ENSMUST00000082763 144 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Neat1-201ENSMUST00000173672 20771 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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