Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Usp34-208ENSMUST00000180046 12200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps42-201ENSMUST00000174123 2083 ntBASIC2.53□□□□□ -2
NipblQ6KCD5 Olfr1251-202ENSMUST00000214639 3071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm37456-201ENSMUST00000193176 5837 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm18330-201ENSMUST00000199246 547 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm12586-201ENSMUST00000117328 1316 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1379-ps1-201ENSMUST00000120726 1001 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Olfr235-205ENSMUST00000214638 3459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NipblQ6KCD5 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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