Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr769-202ENSMUST00000215453 4143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r181-201ENSMUST00000181796 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn2r86-201ENSMUST00000170257 3039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43092-201ENSMUST00000202986 1854 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm11623-201ENSMUST00000120176 1225 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Trdv1-202ENSMUST00000187163 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43825-201ENSMUST00000199650 734 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm44050-201ENSMUST00000204263 527 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC160958.1-201ENSMUST00000224833 368 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms