Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm8231-201ENSMUST00000221617 783 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC156576.2-202ENSMUST00000222525 411 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 2900079G21Rik-204ENSMUST00000163302 2764 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm23959-201ENSMUST00000157208 324 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Mir3970-201ENSMUST00000199287 90 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Cetn2-201ENSMUST00000033713 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 E330014E10Rik-201ENSMUST00000071182 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm37086-201ENSMUST00000193082 3452 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm3183-202ENSMUST00000201703 2048 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Zp3r-201ENSMUST00000039862 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1494-202ENSMUST00000207836 2100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm44370-201ENSMUST00000175436 112 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm44984-201ENSMUST00000207802 394 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Cdrt4-201ENSMUST00000035854 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ubxn2bQ0KL01 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms