Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm25603-201ENSMUST00000158361 105 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Acrv1-201ENSMUST00000034620 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 4930473O22Rik-201ENSMUST00000218283 1465 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Hoxd1Q01822 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15517-201ENSMUST00000124863 251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22836-201ENSMUST00000158441 61 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm26028-201ENSMUST00000158660 294 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm18597-201ENSMUST00000209519 694 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 AC160999.1-201ENSMUST00000225675 810 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr168-201ENSMUST00000078554 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Cysltr1-202ENSMUST00000113480 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22080-201ENSMUST00000157591 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Hoxd1Q01822 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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