Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm11372-201ENSMUST00000117348 570 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr325-201ENSMUST00000169428 1065 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Hhla1-201ENSMUST00000100584 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm22758-201ENSMUST00000102275 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm45796-201ENSMUST00000212483 114 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC161250.1-201ENSMUST00000213426 1111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC153532.1-201ENSMUST00000218126 1111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr745-201ENSMUST00000062534 1175 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1436-201ENSMUST00000087812 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm3089-201ENSMUST00000200804 1395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm3302-201ENSMUST00000201462 1395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms