Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprkP35822 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprkP35822 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprkP35822 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm13438-201ENSMUST00000120100 573 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm37900-201ENSMUST00000195510 3805 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Olfr824-201ENSMUST00000074161 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
PtprkP35822 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 2500002B13Rik-202ENSMUST00000210752 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr192-201ENSMUST00000080251 925 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Fsd1l-203ENSMUST00000132151 7467 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm37966-201ENSMUST00000193122 326 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PtprkP35822 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Obox4-ps12-201ENSMUST00000180084 1362 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprkP35822 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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