Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Igkv13-56-1-201ENSMUST00000198481 209 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC133910.1-201ENSMUST00000228128 624 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC164437.2-201ENSMUST00000228915 797 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm13212-201ENSMUST00000097794 1221 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Vpreb1P13372 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Vpreb1P13372 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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