Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Ighv5-8-201ENSMUST00000166255 278 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23972-201ENSMUST00000083322 165 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn2r88-202ENSMUST00000159674 3098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1308-202ENSMUST00000207560 2093 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm43914-201ENSMUST00000203592 594 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC159619.1-201ENSMUST00000219118 318 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Pold3-209ENSMUST00000208670 1716 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gabra3-202ENSMUST00000114554 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25784-201ENSMUST00000122524 81 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm45489-201ENSMUST00000211753 443 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC157515.1-201ENSMUST00000220953 450 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.8 ms