Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm18327-201ENSMUST00000202426 830 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm44871-201ENSMUST00000207821 497 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr1318-205ENSMUST00000217533 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Mir147-201ENSMUST00000102354 79 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm7618-201ENSMUST00000121643 171 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm13555-201ENSMUST00000121668 319 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm15038-201ENSMUST00000122144 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm18354-201ENSMUST00000173515 1068 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm17887-201ENSMUST00000200194 547 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Ano5-201ENSMUST00000043944 7785 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Vmn1r43-205ENSMUST00000228709 12646 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Grik3B1AS29 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms