Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm16274-201ENSMUST00000139251 592 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Gm11339-201ENSMUST00000154766 490 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Col4a3Q9QZS0 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Mbd3l1-203ENSMUST00000215255 708 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Ak6-202ENSMUST00000084721 1222 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm9314-201ENSMUST00000199881 1528 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Mga-204ENSMUST00000110774 13931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Hyal6-201ENSMUST00000031690 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm24190-201ENSMUST00000157976 216 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 D830005E20Rik-202ENSMUST00000219691 971 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm25004-201ENSMUST00000083811 161 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm37494-202ENSMUST00000188038 16021 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm13147-202ENSMUST00000177526 1173 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm4052-201ENSMUST00000220890 451 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Serpinb9e-201ENSMUST00000071873 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm37911-201ENSMUST00000193099 1545 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Col4a3Q9QZS0 Trav10n-201ENSMUST00000103612 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.7 ms