Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 CT009711.3-201ENSMUST00000225882 250 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr1123-201ENSMUST00000054974 972 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr776-201ENSMUST00000073704 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr774-201ENSMUST00000097164 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Zfp266-202ENSMUST00000174462 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Mup-ps17-201ENSMUST00000120723 218 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm14564-201ENSMUST00000122159 294 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 4933440J02Rik-201ENSMUST00000181547 1144 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm29130-201ENSMUST00000191015 618 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm44355-201ENSMUST00000200417 104 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm21320-201ENSMUST00000211875 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm37674-201ENSMUST00000194177 1834 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Kctd12b-201ENSMUST00000039424 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC158686.2-201ENSMUST00000218599 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm19233-201ENSMUST00000219772 936 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Olfr1104-201ENSMUST00000099869 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SgshQ9EQ08 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms