Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm2544-201ENSMUST00000222702 756 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm17752-201ENSMUST00000185787 3726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm25806-201ENSMUST00000122782 122 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm11579-201ENSMUST00000145502 845 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm6900-201ENSMUST00000178971 342 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr500-ps1-201ENSMUST00000208818 933 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr188-ps1-202ENSMUST00000220235 925 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm22864-201ENSMUST00000083950 130 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1099-201ENSMUST00000099871 1031 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1269-202ENSMUST00000214404 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm15030-201ENSMUST00000119804 484 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Ighv1-41-201ENSMUST00000194414 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr886-ps1-201ENSMUST00000212395 708 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC154313.1-201ENSMUST00000217755 3841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC164297.5-201ENSMUST00000224365 198 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 E330017A01Rik-201ENSMUST00000053249 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Clec9a-202ENSMUST00000088075 1020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Usp38Q8BW70 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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