Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm23099-201ENSMUST00000083454 139 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr1196-202ENSMUST00000216928 4270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Rbm41-202ENSMUST00000087400 2229 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Hbp1-204ENSMUST00000175686 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm12724-201ENSMUST00000140196 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm16250-201ENSMUST00000148974 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm37682-201ENSMUST00000191776 522 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm17780-201ENSMUST00000207142 612 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 AC133101.1-201ENSMUST00000226939 1199 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr1458-202ENSMUST00000215160 1914 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Tnfrsf26-202ENSMUST00000208124 3062 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Vmn2r107-201ENSMUST00000042090 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Tcrg-C1-201ENSMUST00000103558 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxa13Q62424 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.1 ms