Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm9696-201ENSMUST00000094227 3050 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14772-201ENSMUST00000116562 514 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr1490-201ENSMUST00000080162 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Ncald-202ENSMUST00000116445 858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm12650-201ENSMUST00000121966 258 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm25807-201ENSMUST00000122783 305 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm6137-201ENSMUST00000187552 578 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Trappc1Q5NCF2 4930558C23Rik-201ENSMUST00000196239 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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Trappc1Q5NCF2 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r25-202ENSMUST00000228585 909 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Vmn2r125-201ENSMUST00000096794 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Trappc1Q5NCF2 Gm42736-201ENSMUST00000200723 1353 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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