Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
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Znf48Q3US17 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Papolg-201ENSMUST00000020513 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Znf48Q3US17 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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