Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm6710-202ENSMUST00000109012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm14391-206ENSMUST00000165892 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Q3U6N9 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm45378-201ENSMUST00000211063 2711 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm24636-201ENSMUST00000158673 288 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm5258-201ENSMUST00000165437 327 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Mir5710-201ENSMUST00000176884 69 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm31717-201ENSMUST00000213044 668 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Olfr1089-201ENSMUST00000214317 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 AC152946.2-201ENSMUST00000219071 337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Q3U6N9 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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