Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC123705.4-201ENSMUST00000222411 493 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC126275.1-201ENSMUST00000224881 446 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Trim71Q1PSW8 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm13731-201ENSMUST00000117332 196 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm6650-201ENSMUST00000166710 614 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps34-201ENSMUST00000174046 943 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn1r14-201ENSMUST00000177435 912 ntAPPRIS P2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm27755-201ENSMUST00000184623 132 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Amd-ps5-201ENSMUST00000198406 989 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr805-201ENSMUST00000078876 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Sult2a4-202ENSMUST00000165167 964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm38061-201ENSMUST00000192490 365 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr918-201ENSMUST00000055099 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Trim71Q1PSW8 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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