Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm3267-201ENSMUST00000118671 473 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm44646-201ENSMUST00000205847 421 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Glyat-202ENSMUST00000119960 3296 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
ptchd1Q14B62 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm9923-201ENSMUST00000217785 1836 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Far2-202ENSMUST00000111607 3395 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Hmgb1-ps5-201ENSMUST00000121058 557 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 1700013N06Rik-201ENSMUST00000156376 663 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm23977-201ENSMUST00000177871 74 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm43631-201ENSMUST00000202011 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
ptchd1Q14B62 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms