Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm33962-202ENSMUST00000205195 630 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 2900078I11Rik-201ENSMUST00000214556 999 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC131677.1-201ENSMUST00000218721 535 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC125531.1-201ENSMUST00000219849 221 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Vmn1r66-203ENSMUST00000227719 2765 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm10319-201ENSMUST00000078431 1355 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm11805-201ENSMUST00000121238 600 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm27188-201ENSMUST00000184383 510 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Mup5-201ENSMUST00000082287 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AW112010-201ENSMUST00000099676 770 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Svet1-201ENSMUST00000209370 3940 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm13582-201ENSMUST00000146034 2655 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm11830-201ENSMUST00000120175 561 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NcstnP57716 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms