Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
VdrP48281 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
VdrP48281 Ankrd49-202ENSMUST00000214456 3207 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
VdrP48281 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr910-201ENSMUST00000215122 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm14472-201ENSMUST00000119815 282 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr405-ps1-201ENSMUST00000120649 936 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm23964-201ENSMUST00000157966 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Malrd1-201ENSMUST00000146205 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Zfp101-201ENSMUST00000167107 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Ctsm-202ENSMUST00000223778 1905 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Abcc2-202ENSMUST00000099413 1926 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gimd1-202ENSMUST00000196701 654 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Gm45646-201ENSMUST00000210983 441 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
VdrP48281 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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