Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15263-201ENSMUST00000121556 642 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22613-201ENSMUST00000122679 292 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14684-201ENSMUST00000145722 123 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23098-201ENSMUST00000157552 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm8296-201ENSMUST00000185597 524 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm32772-201ENSMUST00000205898 594 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr566-202ENSMUST00000209952 1066 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm45539-201ENSMUST00000210313 428 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC139638.1-201ENSMUST00000218027 364 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr998-201ENSMUST00000052307 1012 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr566-201ENSMUST00000071393 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Zfp260-202ENSMUST00000108200 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr744-203ENSMUST00000216690 1765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14387-201ENSMUST00000121827 2055 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm15195-201ENSMUST00000118775 263 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm16290-201ENSMUST00000161175 474 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm37431-201ENSMUST00000195102 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr206-202ENSMUST00000207927 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rpl28P41105 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm38090-201ENSMUST00000195733 1942 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 A630033H20Rik-206ENSMUST00000180182 2997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1314-202ENSMUST00000207976 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rpl28P41105 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms