Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 2210017I01Rik-201ENSMUST00000195278 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr103-201ENSMUST00000058826 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr784-202ENSMUST00000214064 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
VhlP40338 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm40038-201ENSMUST00000197878 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Mir690-201ENSMUST00000102110 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm14788-201ENSMUST00000119457 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm28148-201ENSMUST00000186924 697 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 2900060B14Rik-201ENSMUST00000203191 616 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1480-201ENSMUST00000072219 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm7173-203ENSMUST00000179788 1254 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1487-201ENSMUST00000076856 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VhlP40338 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms