Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm43151-201ENSMUST00000201093 657 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
P10404 Adam28-201ENSMUST00000022642 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr780-202ENSMUST00000215503 2910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Hnmt-202ENSMUST00000114497 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Vmn2r-ps2-201ENSMUST00000121053 765 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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P10404 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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P10404 Gm29334-201ENSMUST00000190334 357 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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P10404 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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P10404 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
P10404 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
P10404 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
P10404 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
P10404 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
P10404 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms