Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Pcsk2os2-201ENSMUST00000153878 3370 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr17-202ENSMUST00000210568 3666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ccr2-202ENSMUST00000165984 3515 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm12719-201ENSMUST00000118859 241 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 A830019L24Rik-202ENSMUST00000198056 3165 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
NebE9Q1W3 Gm14325-201ENSMUST00000108939 1576 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mir7026-201ENSMUST00000184384 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm37982-201ENSMUST00000193076 561 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Sult2a7-202ENSMUST00000209744 792 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 1700017N19Rik-201ENSMUST00000041162 1691 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Rab30-201ENSMUST00000032879 9456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 G930045G22Rik-201ENSMUST00000101402 480 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm14606-201ENSMUST00000117078 1155 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
NebE9Q1W3 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms