Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Mmp12-203ENSMUST00000120655 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 CT009733.2-202ENSMUST00000224171 4748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Il6-203ENSMUST00000199183 2343 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm36548-201ENSMUST00000197473 685 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm2888-201ENSMUST00000170521 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm7876-202ENSMUST00000171305 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Kynu-202ENSMUST00000050511 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Nxf7-201ENSMUST00000033784 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 n-R5s174-201ENSMUST00000122638 121 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm23837-201ENSMUST00000122656 286 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Spocd1B1ASB6 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms