Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Sprr2d-201ENSMUST00000047477 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Olfr365-201ENSMUST00000074168 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Zpld1-202ENSMUST00000143914 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 F830016B08Rik-201ENSMUST00000171297 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Dnajc13-203ENSMUST00000186788 6747 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Mir7087-201ENSMUST00000184840 70 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 4930532M18Rik-202ENSMUST00000190980 534 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Limd1Q9QXD8 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
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